POU4F3

POU4F3
Ідентифікатори
Символи POU4F3, BRN3C, DFNA15, POU class 4 homeobox 3, DFNA42, DFNA52
Зовнішні ІД OMIM: 602460 MGI: 102523 HomoloGene: 2023 GeneCards: POU4F3
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant nonsyndromic deafness 15, nonsyndromic deafness[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро
цитоплазма

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
слух
inner ear development
зір
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
диференціація клітин
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
vestibulocochlear nerve development
retinal ganglion cell axon guidance
inner ear morphogenesis
inner ear auditory receptor cell differentiation
axon extension
neuromuscular process controlling balance
neuron apoptotic process
inner ear receptor cell differentiation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5459
18998
Ensembl
ENSG00000091010
ENSMUSG00000024497
UniProt
Q15319
Q63955
RefSeq (мРНК)
NM_002700
NM_138945
RefSeq (білок)
NP_002691
NP_620395
Локус (UCSC) Хр. 5: 146.34 – 146.34 Mb Хр. 18: 42.53 – 42.53 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

POU4F3 (англ. POU class 4 homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 37 052[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMAMNSKQPFGMHPVLQEPKFSSLHSGSEAMRRVCLPAPQLQGNIFGSFD
ESLLARAEALAAVDIVSHGKNHPFKPDATYHTMSSVPCTSTSSTVPISHP
AALTSHPHHAVHQGLEGDLLEHISPTLSVSGLGAPEHSVMPAQIHPHHLG
AMGHLHQAMGMSHPHTVAPHSAMPACLSDVESDPRELEAFAERFKQRRIK
LGVTQADVGAALANLKIPGVGSLSQSTICRFESLTLSHNNMIALKPVLQA
WLEEAEAAYREKNSKPELFNGSERKRKRTSIAAPEKRSLEAYFAIQPRPS
SEKIAAIAEKLDLKKNVVRVWFCNQRQKQKRMKYSAVH

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з POU4F3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9220 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
  5. UniProt, Q15319 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші