JDP2

JDP2
Ідентифікатори
Символи JDP2, JUNDM2, Jun dimerization protein 2
Зовнішні ІД OMIM: 608657 MGI: 1932093 HomoloGene: 12787 GeneCards: JDP2
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
double-stranded DNA binding
chromatin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein heterodimerization activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001106 transcription corepressor activity

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

positive regulation of histone deacetylation
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of fat cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of histone deacetylation
transcription, DNA-templated

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
122953
81703
Ensembl
ENSG00000140044
ENSMUSG00000034271
UniProt
Q8WYK2
P97875
RefSeq (мРНК)
NM_001135047
NM_001135048
NM_001135049
NM_130469
NM_001205052
NM_001205053
NM_030887
NM_001401266
RefSeq (білок)
NP_001128519
NP_001128520
NP_001128521
NP_569736
NP_001191981
NP_001191982
NP_112149
NP_001388195
Локус (UCSC) Хр. 14: 75.43 – 75.47 Mb Хр. 12: 85.65 – 85.69 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

JDP2 (англ. Jun dimerization protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 163 амінокислот, а молекулярна маса — 18 704[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMPGQIPDPSVTTGSLPGLGPLTGLPSSALTVEELKYADIRNLGAMIAPL
HFLEVKLGKRPQPVKSELDEEEERRKRRREKNKVAAARCRNKKKERTEFL
QRESERLELMNAELKTQIEELKQERQQLILMLNRHRPTCIVRTDSVKTPE
SEGNPLLEQLEKK

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Murata T., Shinozuka Y., Obata Y., Yokoyama K.K. (2008). Phosphorylation of two eukaryotic transcription factors, Jun dimerization protein 2 and activation transcription factor 2, in Escherichia coli by Jun N-terminal kinase 1. Anal. Biochem. 376: 115—121. PMID 18307971 DOI:10.1016/j.ab.2008.01.038
  • Kimura M. (2008). IRF2-binding protein-1 is a JDP2 ubiquitin ligase and an inhibitor of ATF2-dependent transcription. FEBS Lett. 582: 2833—2837. PMID 18671972 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.033
  • Jin C., Li H., Ugai H., Murata T., Yokoyama K.K. (2002). Transcriptional regulation of the c-jun gene by AP-1 repressor protein JDP2 during the differentiation of F9 cells. Nucleic Acids Res. Suppl. 2: 97—98. PMID 12903123

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з JDP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17546 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, Q8WYK2 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші