ATF1

ATF1
Ідентифікатори
Символи ATF1, EWS-FUS/ATF-1, TREB36, activating transcription factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 123803 MGI: 3037720 HomoloGene: 3790 GeneCards: ATF1
Пов'язані генетичні захворювання
Angiomatoid fibrous histiocytoma[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• DNA binding
• sequence-specific DNA binding
• RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• protein heterodimerization activity
• transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
• identical protein binding
• GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
• GO:0032403 protein-containing complex binding

Клітинна компонента

• ATF1-ATF4 transcription factor complex
• transcription regulator complex
• нуклеоплазма
• клітинне ядро

Біологічний процес

• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• GO:1904578 response to organic cyclic compound
• transcription, DNA-templated
• positive regulation of DNA replication
• positive regulation of neuron projection development
• response to cobalt ion
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• transcription by RNA polymerase II
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
466
100040260
Ensembl
ENSG00000123268
ENSMUSG00000080968
UniProt
P18846
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_005171
XM_036162179
RefSeq (білок)
NP_005162
н/д
Локус (UCSC) Хр. 12: 50.76 – 50.82 Mb Хр. X: 52.89 – 52.89 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ATF1 (англ. Activating transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 271 амінокислот, а молекулярна маса — 29 233[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEDSHKSTTSETAPQPGSAVQGAHISHIAQQVSSLSESEESQDSSDSIGS
SQKAHGILARRPSYRKILKDLSSEDTRGRKGDGENSGVSAAVTSMSVPTP
IYQTSSGQYIAIAPNGALQLASPGTDGVQGLQTLTMTNSGSTQQGTTILQ
YAQTSDGQQILVPSNQVVVQTASGDMQTYQIRTTPSATSLPQTVVMTSPV
TLTSQTTKTDDPQLKREIRLMKNREAARECRRKKKEYVKCLENRVAVLEN
QNKTLIEELKTLKDLYSNKSV

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
  • Waters B.L., Panagopoulos I., Allen E.F. (2000). Genetic characterization of angiomatoid fibrous histiocytoma identifies fusion of the FUS and ATF-1 genes induced by a chromosomal translocation involving bands 12q13 and 16p11. Cancer Genet. Cytogenet. 121: 109—116. PMID 11063792 DOI:10.1016/S0165-4608(00)00237-5
  • Sun P., Lou L., Maurer R.A. (1996). Regulation of activating transcription factor-1 and the cAMP response element-binding protein by Ca2+/calmodulin-dependent protein kinases type I, II, and IV. J. Biol. Chem. 271: 3066—3073. PMID 8621702 DOI:10.1074/jbc.271.6.3066
  • Hailemariam K., Iwasaki K., Huang B.W., Sakamoto K., Tsuji Y. (2010). Transcriptional regulation of ferritin and antioxidant genes by HIPK2 under genotoxic stress. J. Cell Sci. 123: 3863—3871. PMID 20980392 DOI:10.1242/jcs.073627
  • Yoshimura T., Fujisawa J., Yoshida M. (1990). Multiple cDNA clones encoding nuclear proteins that bind to the tax-dependent enhancer of HTLV-1: all contain a leucine zipper structure and basic amino acid domain. EMBO J. 9: 2537—2542. PMID 2196176

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ATF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:783 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P18846 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші