BCL11B

BCL11B
Ідентифікатори
Символи BCL11B, ATL1, ATL1-alpha, ATL1-beta, ATL1-delta, ATL1-gamma, CTIP-2, CTIP2, RIT1, ZNF856B, hRIT1-alpha, B-cell CLL/lymphoma 11B, IMD49, B cell CLL/lymphoma 11B, IDDFSTA, BAF complex component, BAF chromatin remodeling complex subunit SMARCM2
Зовнішні ІД OMIM: 606558 MGI: 1929913 HomoloGene: 10974 GeneCards: BCL11B
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
зв'язування з іоном металу
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity

Клітинна компонента

внутрішньоклітинний
neuron projection
клітинне ядро

Біологічний процес

commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain
regulation of neuron differentiation
Нейрогенез
olfactory bulb axon guidance
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
T cell differentiation in thymus
аксоноґенеза
epithelial cell morphogenesis
thymus development
T cell receptor V(D)J recombination
negative regulation of apoptotic process
transcription by RNA polymerase II
post-embryonic development
positive T cell selection
transcription, DNA-templated
striatal medium spiny neuron differentiation
odontogenesis of dentin-containing tooth
regulation of lipid metabolic process
keratinocyte development
post-embryonic camera-type eye development
central nervous system neuron differentiation
регуляція експресії генів
alpha-beta T cell differentiation
regulation of keratinocyte proliferation
GO:0072468 сигнальна трансдукція
negative regulation of cell population proliferation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
skin development
hematopoietic stem cell migration
lymphoid lineage cell migration into thymus

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
64919
58208
Ensembl
ENSG00000127152
ENSMUSG00000048251
UniProt
Q9C0K0
Q99PV8
RefSeq (мРНК)
NM_001282237
NM_001282238
NM_022898
NM_138576
NM_001079883
NM_001286343
NM_021399
RefSeq (білок)
NP_001269166
NP_001269167
NP_075049
NP_612808
NP_001073352
NP_001273272
NP_067374
Локус (UCSC) Хр. 14: 99.17 – 99.27 Mb Хр. 12: 107.88 – 107.97 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

BCL11B (англ. B-cell CLL/lymphoma 11B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 894 амінокислот, а молекулярна маса — 95 519[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGG
PDPDLLTCGQCQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPP
SSRSELRKVSEPVEIGIQVTPDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGPCRPAQL
PAVAPIAASSHPHSSVITSPLRALGALPPCLPLPCCSARPVSGDGTQGEG
QTEAPFGCQCQLSGKDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHAQNTHGFRIYL
EPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNFLGDSNPFNLLRMTGPILR
DHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHRLSAEEMGLVAQHPSAFDRVMR
LNPMAIDSPAMDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPK
SPFLSTPPLPPMPPGGTPPPQPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHT
GEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKTHMHKAGSLAGRSDDGLSAASSPEP
GTSELAGEGLKAADGDFRHHESDPSLGHEPEEEDEEEEEEEEELLLENES
RPESSFSMDSELSRNRENGGGGVPGVPGAGGGAAKALADEKALVLGKVME
NVGLGALPQYGELLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAGGCGDAGAGGA
VNGRGGGFAPGTEPFPGLFPRKPAPLPSPGLNSAAKRIKVEKDLELPPAA
LIPSENVYSQWLVGYAASRHFMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSL
RFSTPPGDLLDGGLSGRSGTASGGSTPHLGGPGPGRPSSKEGRRSDTCEY
CGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQSSKLTRHMKTHGQIG
KEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGEHLLTNDVKIEQAERS

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13222 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9C0K0 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші