ZNF408

Ідентифікатори

Символи

ZNF408, EVR6, RP72, zinc finger protein 408

Зовнішні ІД

OMIM: 616454 MGI: 2685857 HomoloGene: 11687 GeneCards: ZNF408

Пов'язані генетичні захворювання

retinitis pigmentosa 72^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79797


381410

Ensembl


ENSG00000175213


ENSMUSG00000075040

UniProt


Q9H9D4


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_024741 NM_001184751


NM_001033451 NM_001347175

RefSeq (білок)


NP_001171680 NP_079017


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 11: 46.7 – 46.71 Mb

Хр. 2: 91.47 – 91.48 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZNF408 (англ. Zinc finger protein 408) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 720 амінокислот, а молекулярна маса — 78 439^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEAEELLLE	GKKALQLARE	PRLGLDLGWN	PSGEGCTQGL	KDVPPEPTRD
ILALKSLPRG	LALGPSLAKE	QRLGVWCVGD	PLQPGLLWGP	LEEESASKEK
GEGVKPRQEE	NLSLGPWGDV	CACEQSSGWT	SLVQRGRLES	EGNVAPVRIS
ERLHLQVYQL	VLPGSELLLW	PQPSSEGPSL	TQPGLDKEAA	VAVVTEVESA
VQQEVASPGE	DAAEPCIDPG	SQSPSGIQAE	NMVSPGLKFP	TQDRISKDSQ
PLGPLLQDGD	VDEECPAQAQ	MPPELQSNSA	TQQDPDGSGA	SFSSSARGTQ
PHGYLAKKLH	SPSDQCPPRA	KTPEPGAQQS	GFPTLSRSPP	GPAGSSPKQG
RRYRCGECGK	AFLQLCHLKK	HAFVHTGHKP	FLCTECGKSY	SSEESFKAHM
LGHRGVRPFP	CPQCDKAYGT	QRDLKEHQVV	HSGARPFACD	QCGKAFARRP
SLRLHRKTHQ	VPAAPAPCPC	PVCGRPLANQ	GSLRNHMRLH	TGEKPFLCPH
CGRAFRQRGN	LRGHLRLHTG	ERPYRCPHCA	DAFPQLPELR	RHLISHTGEA
HLCPVCGKAL	RDPHTLRAHE	RLHSGERPFP	CPQCGRAYTL	ATKLRRHLKS
HLEDKPYRCP	TCGMGYTLPQ	SLRRHQLSHR	PEAPCSPPSV	PSAASEPTVV
LLQAEPQLLD	THREEEVSPA	RDVVEVTISE	SQEKCFVVPE	EPDAAPSLVL
IHKDMGLGAW	AEVVEVEMGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZNF408 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20041 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H9D4 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.