WDR36

Ідентифікатори

Символи

WDR36, GLC1G, TA-WDRP, TAWDRP, UTP21, WD repeat domain 36

Зовнішні ІД

OMIM: 609669 MGI: 1917819 HomoloGene: 6536 GeneCards: WDR36

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • small-subunit processome • Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome
Біологічний процес	• retina homeostasis • regulation of axon extension • ribosome biogenesis • відповідь на стимул • зір • rRNA processing • GO:0022610 життєдіяльність
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


134430


225348

Ensembl


ENSG00000134987


ENSMUSG00000038299

UniProt


Q8NI36


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_139281


NM_001110015 NM_001110016 NM_144863

RefSeq (білок)


NP_644810


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 5: 111.09 – 111.13 Mb

Хр. 18: 32.97 – 33 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

WDR36 (англ. WD repeat domain 36) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 951 амінокислот, а молекулярна маса — 105 322^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCCTEGSLRK	RDSQRAPEAV	LCLQLWQRTV	PLDTLKGLGT	CFPSGPELRG
AGIAAAMERA	SERRTASALF	AGFRALGLFS	NDIPHVVRFS	ALKRRFYVTT
CVGKSFHTYD	VQKLSLVAVS	NSVPQDICCM	AADGRLVFAA	YGNVFSAFAR
NKEIVHTFKG	HKAEIHFLQP	FGDHIISVDT	DGILIIWHIY	SEEEYLQLTF
DKSVFKISAI	LHPSTYLNKI	LLGSEQGSLQ	LWNVKSNKLL	YTFPGWKVGV
TALQQAPAVD	VVAIGLMSGQ	VIIHNIKFNE	TLMKFRQDWG	PITSISFRTD
GHPVMAAGSP	CGHIGLWDLE	DKKLINQMRN	AHSTAIAGLT	FLHREPLLVT
NGADNALRIW	IFDGPTGEGR	LLRFRMGHSA	PLTNIRYYGQ	NGQQILSASQ
DGTLQSFSTV	HEKFNKSLGH	GLINKKRVKR	KGLQNTMSVR	LPPITKFAAE
EARESDWDGI	IACHQGKLSC	STWNYQKSTI	GAYFLKPKEL	KKDDITATAV
DITSCGNFAV	IGLSSGTVDV	YNMQSGIHRG	SFGKDQAHKG	SVRGVAVDGL
NQLTVTTGSE	GLLKFWNFKN	KILIHSVSLS	SSPNIMLLHR	DSGILGLALD
DFSISVLDIE	TRKIVREFSG	HQGQINDMAF	SPDGRWLISA	AMDCSIRTWD
LPSGCLIDCF	LLDSAPLNVS	MSPTGDFLAT	SHVDHLGIYL	WSNISLYSVV
SLRPLPADYV	PSIVMLPGTC	QTQDVEVSEE	TVEPSDELIE	YDSPEQLNEQ
LVTLSLLPES	RWKNLLNLDV	IKKKNKPKEP	PKVPKSAPFF	IPTIPGLVPR
YAAPEQNNDP	QQSKVVNLGV	LAQKSDFCLK	LEEGLVNNKY	DTALNLLKES
GPSGIETELR	SLSPDCGGSI	EVMQSFLKMI	GMMLDRKRDF	ELAQAYLALF
LKLHLKMLPS	EPVLLEEITN	LSSQVEENWT	HLQSLFNQSM	CILNYLKSAL
L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, біогенез рибосом, поліморфізм. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ahmad Y., Boisvert F.M., Lundberg E., Uhlen M., Lamond A.I. (2012). Systematic analysis of protein pools, isoforms, and modifications affecting turnover and subcellular localization. Mol. Cell. Proteomics. 11: M111.013680.01 — M111.013680.15. PMID 22002106 DOI:10.1074/mcp.M111.013680

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30696 (англ.) . Архів оригіналу за 13 жовтня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8NI36 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.