VTI1A

Ідентифікатори

Символи

VTI1A, MMDS3, MVti1, VTI1RP2, Vti1-rp2, vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1A

Зовнішні ІД

OMIM: 614316 MGI: 1855699 HomoloGene: 39963 GeneCards: VTI1A

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • мембрана • Синаптичні бульбашки • autophagosome • neuronal cell body • SNARE complex • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection terminus • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • trans-Golgi network membrane • ER to Golgi transport vesicle membrane • гіалоплазма • Golgi membrane • late endosome membrane • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• voluntary musculoskeletal movement • автофагія • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • intracellular protein transport • Golgi ribbon formation • vesicle-mediated transport • Golgi to vacuole transport • vesicle fusion with Golgi apparatus • intra-Golgi vesicle-mediated transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • protein targeting to vacuole
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


143187


53611

Ensembl


ENSG00000151532


ENSMUSG00000024983

UniProt


Q96AJ9


O89116

RefSeq (мРНК)

NM_145206 NM_001318203 NM_001318205 NM_001365710 NM_001365711
NM_001365712 NM_001365713 NM_001365714


NM_001293685 NM_001293686 NM_016862 NM_001360431 NM_001360432

RefSeq (білок)

NP_001305132 NP_001305134 NP_660207 NP_001352639 NP_001352640
NP_001352641 NP_001352642 NP_001352643


NP_001280614 NP_001280615 NP_058558 NP_001347360 NP_001347361

Локус (UCSC)

Хр. 10: 112.45 – 112.82 Mb

Хр. 19: 55.3 – 55.62 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VTI1A (англ. Vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 25 218^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSDFEGYEQ	DFAVLTAEIT	SKIARVPRLP	PDEKKQMVAN	VEKQLEEAKE
LLEQMDLEVR	EIPPQSRGMY	SNRMRSYKQE	MGKLETDFKR	SRIAYSDEVR
NELLGDDGNS	SENQRAHLLD	NTERLERSSR	RLEAGYQIAV	ETEQIGQEML
ENLSHDREKI	QRARERLRET	DANLGKSSRI	LTGMLRRIIQ	NRILLVILGI
IVVITILMAI	TFSVRRH

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ganley I.G., Espinosa E., Pfeffer S.R. (2008). A syntaxin 10-SNARE complex distinguishes two distinct transport routes from endosomes to the trans-Golgi in human cells. J. Cell Biol. 180: 159—172. PMID 18195106 DOI:10.1083/jcb.200707136
Flowerdew S.E., Burgoyne R.D. (2009). A VAMP7/Vti1a SNARE complex distinguishes a non-conventional traffic route to the cell surface used by KChIP1 and Kv4 potassium channels. Biochem. J. 418: 529—540. PMID 19138172 DOI:10.1042/BJ20081736

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з VTI1A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17792 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96AJ9 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.