UBE2D2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UR6, 1W4U, 2CLW, 2ESK, 2ESO, 2ESP, 2ESQ, 3A33, 3JVZ, 3JW0, 3L1Y, 3TGD, 3ZNI, 4A49, 4A4B, 4A4C, 4AUQ, 4DDG, 4LDT, 4V3K, 4V3L, 4WZ3, 5D1L, 5D1K, 5D0M, 5D0K, 5D1M, 5EDV

Ідентифікатори

Символи

UBE2D2, E2(17)KB2, PUBC1, UBC4, UBC4/5, UBCH4, UBCH5B, ubiquitin conjugating enzyme E2 D2

Зовнішні ІД

OMIM: 602962 MGI: 1930715 HomoloGene: 2506 GeneCards: UBE2D2

шифр КФ

2.3.2.24

Пов'язані генетичні захворювання

натуральна віспа^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • ubiquitin conjugating enzyme activity • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • ubiquitin ligase complex • нуклеоплазма • екзосома • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • protein K48-linked ubiquitination • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • T cell receptor signaling pathway • protein autoubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • protein targeting to peroxisome • protein K11-linked ubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7322


56550

Ensembl


ENSG00000131508


ENSMUSG00000091896

UniProt


P62837


P62838

RefSeq (мРНК)


NM_003339 NM_181838


NM_019912

RefSeq (білок)


NP_003330 NP_862821


NP_064296

Локус (UCSC)

Хр. 5: 139.53 – 139.63 Mb

Хр. 18: 35.9 – 35.94 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UBE2D2 (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 D2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 147 амінокислот, а молекулярна маса — 16 735^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALKRIHKEL	NDLARDPPAQ	CSAGPVGDDM	FHWQATIMGP	NDSPYQGGVF
FLTIHFPTDY	PFKPPKVAFT	TRIYHPNINS	NGSICLDILR	SQWSPALTIS
KVLLSICSLL	CDPNPDDPLV	PEIARIYKTD	REKYNRIARE	WTQKYAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

Jensen J.P., Bates P.W., Yang M., Vierstra R.D., Weissman A.M. (1995). Identification of a family of closely related human ubiquitin conjugating enzymes. J. Biol. Chem. 270: 30408—30414. PMID 8530467 DOI:10.1074/jbc.270.51.30408
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yu P., Chen Y., Tagle D.A., Cai T. (2002). PJA1, encoding a RING-H2 finger ubiquitin ligase, is a novel human X chromosome gene abundantly expressed in brain. Genomics. 79: 869—874. PMID 12036302 DOI:10.1006/geno.2002.6770
Windheim M., Peggie M., Cohen P. (2008). Two different classes of E2 ubiquitin-conjugating enzymes are required for the mono-ubiquitination of proteins and elongation by polyubiquitin chains with a specific topology. Biochem. J. 409: 723—729. PMID 18042044 DOI:10.1042/BJ20071338
Chiang M.H., Chen L.F., Chen H. (2008). Ubiquitin-conjugating enzyme UBE2D2 is responsible for FBXW2 (F-box and WD repeat domain containing 2)-mediated human GCM1 (glial cell missing homolog 1) ubiquitination and degradation. Biol. Reprod. 79: 914—920. PMID 18703417 DOI:10.1095/biolreprod.108.071407
Zeng W., Xu M., Liu S., Sun L., Chen Z.J. (2009). Key role of Ubc5 and lysine-63 polyubiquitination in viral activation of IRF3. Mol. Cell. 36: 315—325. PMID 19854139 DOI:10.1016/j.molcel.2009.09.037

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з UBE2D2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12475 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, P62837 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2018. Процитовано 5 вересня 2017.