TNFAIP6 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TNFAIP6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1O7B, 1O7C, 2PF5, 2WNO, 2N40

Ідентифікатори

Символи

TNFAIP6, TSG-6, TSG6, TNF alpha induced protein 6

Зовнішні ІД

OMIM: 600410 MGI: 1195266 HomoloGene: 5162 GeneCards: TNFAIP6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• hyaluronic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen
Біологічний процес	• cell-cell signaling • адгезія клітин • inflammatory response • negative regulation of inflammatory response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell migration • овуляція • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7130


21930

Ensembl


ENSG00000123610


ENSMUSG00000053475

UniProt


P98066


O08859

RefSeq (мРНК)


NM_007115


NM_009398

RefSeq (білок)


NP_009046


NP_033424

Локус (UCSC)

Хр. 2: 151.36 – 151.38 Mb

Хр. 2: 51.93 – 51.95 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TNFAIP6 (англ. TNF alpha induced protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 31 203^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIILIYLFLL	LWEDTQGWGF	KDGIFHNSIW	LERAAGVYHR	EARSGKYKLT
YAEAKAVCEF	EGGHLATYKQ	LEAARKIGFH	VCAAGWMAKG	RVGYPIVKPG
PNCGFGKTGI	IDYGIRLNRS	ERWDAYCYNP	HAKECGGVFT	DPKQIFKSPG
FPNEYEDNQI	CYWHIRLKYG	QRIHLSFLDF	DLEDDPGCLA	DYVEIYDSYD
DVHGFVGRYC	GDELPDDIIS	TGNVMTLKFL	SDASVTAGGF	QIKYVAMDPV
SKSSQGKNTS	TTSTGNKNFL	AGRFSHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм.

Література

Lee T.H., Wisniewski H.-G., Vilcek J. (1992). A novel secretory tumor necrosis factor-inducible protein (TSG-6) is a member of the family of hyaluronate binding proteins, closely related to the adhesion receptor CD44. J. Cell Biol. 116: 545—557. PMID 1730767 DOI:10.1083/jcb.116.2.545
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wisniewski H.-G., Burgess W.H., Oppenheim J.D., Vilcek J. (1994). TSG-6, an arthritis-associated hyaluronan binding protein, forms a stable complex with the serum protein inter-alpha-inhibitor. Biochemistry. 33: 7423—7429. PMID 7516184 DOI:10.1021/bi00189a049

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11898 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P98066 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.