SYT4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1UGK

Ідентифікатори

Символи

SYT4, HsT1192, synaptotagmin 4

Зовнішні ІД

OMIM: 600103 MGI: 101759 HomoloGene: 7559 GeneCards: SYT4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • clathrin binding • phosphatidylserine binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • syntaxin-1 binding • syntaxin binding • syntaxin-3 binding • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • calcium-dependent phospholipid binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • dense core granule • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • дендрит (нейробіологія) • комплекс Ґольджі • везикула • аксон • клітинна мембрана • Синаптичні бульбашки • integral component of Golgi membrane • integral component of synaptic vesicle membrane • secretory granule membrane • dense core granule membrane • somatodendritic compartment • neuronal cell body • neuron projection terminus • exocytic vesicle • astrocyte projection • microvesicle • glutamatergic synapse • integral component of neuronal dense core vesicle membrane
Біологічний процес	• диференціація клітин • brain development • positive regulation of dendrite extension • negative regulation of vesicle fusion • GO:0010554 neurotransmitter secretion • екзоцитоз • vesicle fusion • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • пам'ять • positive regulation of glutamate secretion • regulation of dopamine secretion • regulation of endocytosis • regulation of vesicle fusion • negative regulation of catecholamine secretion • positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis • negative regulation of neurotransmitter secretion • negative regulation of short-term neuronal synaptic plasticity • vesicle fusion with vesicle • secretory granule maturation • negative regulation of protein secretion • negative regulation of retrograde trans-synaptic signaling by neuropeptide • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis • trans-synaptic signaling by BDNF, modulating synaptic transmission • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion • regulation of presynaptic dense core granule exocytosis • negative regulation of dense core granule exocytosis • positive regulation of dense core granule exocytosis • negative regulation of synaptic vesicle exocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6860


20983

Ensembl


ENSG00000132872


ENSMUSG00000024261

UniProt


Q9H2B2


P40749

RefSeq (мРНК)


NM_020783


NM_009308

RefSeq (білок)


NP_065834


NP_033334

Локус (UCSC)

Хр. 18: 43.27 – 43.28 Mb

Хр. 18: 31.57 – 31.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYT4 (англ. Synaptotagmin 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 47 958^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPITTSREE	FDEIPTVVGI	FSAFGLVFTV	SLFAWICCQR	KSSKSNKTPP
YKFVHVLKGV	DIYPENLNSK	KKFGADDKNE	VKNKPAVPKN	SLHLDLEKRD
LNGNFPKTNL	KPGSPSDLEN	ATPKLFLEGE	KESVSPESLK	SSTSLTSEEK
QEKLGTLFFS	LEYNFERKAF	VVNIKEARGL	PAMDEQSMTS	DPYIKMTILP
EKKHKVKTRV	LRKTLDPAFD	ETFTFYGIPY	TQIQELALHF	TILSFDRFSR
DDIIGEVLIP	LSGIELSEGK	MLMNREIIKR	NVRKSSGRGE	LLISLCYQST
TNTLTVVVLK	ARHLPKSDVS	GLSDPYVKVN	LYHAKKRISK	KKTHVKKCTP
NAVFNELFVF	DIPCEGLEDI	SVEFLVLDSE	RGSRNEVIGQ	LVLGAAAEGT
GGEHWKEICD	YPRRQIAKWH	VLCDG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

Ferguson G.D., Chen X.-N., Korenberg J.R., Herschman H.R. (2000). The human synaptotagmin IV gene defines an evolutionary break point between syntenic mouse and human chromosome regions but retains ligand inducibility and tissue specificity. J. Biol. Chem. 275: 36920—36926. PMID 10938284 DOI:10.1074/jbc.M005801200
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11512 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H2B2 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.