PYGO2

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2XB1, 4UP0, 4UP5

Ідентифікатори

Символи

PYGO2, 1190004M21Rik, pygopus family PHD finger 2

Зовнішні ІД

OMIM: 606903 MGI: 1916161 HomoloGene: 44519 GeneCards: PYGO2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0031493 histone binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding • histone acetyltransferase regulator activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро • beta-catenin-TCF complex
Біологічний процес	• roof of mouth development • regulation of histone H3-K4 methylation • in utero embryonic development • regulation of mammary gland epithelial cell proliferation • positive regulation of chromatin binding • mammary gland development • brain development • lens development in camera-type eye • developmental growth • regulation of histone acetylation • spermatid development • canonical Wnt signaling pathway • beta-catenin-TCF complex assembly • розвиток нирки • spermatid nucleus differentiation • post-embryonic development • Wnt signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


90780


68911

Ensembl


ENSG00000163348


ENSMUSG00000047824

UniProt


Q9BRQ0


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_138300


NM_001293763 NM_001293766 NM_001293767 NM_001293768 NM_026869

RefSeq (білок)


NP_612157


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 154.96 – 154.96 Mb

Хр. 3: 89.34 – 89.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PYGO2 (англ. Pygopus family PHD finger 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 41 244^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAASAPPPPD	KLEGGGGPAP	PPAPPSTGRK	QGKAGLQMKS	PEKKRRKSNT
QGPAYSHLTE	FAPPPTPMVD	HLVASNPFED	DFGAPKVGVA	APPFLGSPVP
FGGFRVQGGM	AGQVPPGYST	GGGGGPQPLR	RQPPPFPPNP	MGPAFNMPPQ
GPGYPPPGNM	NFPSQPFNQP	LGQNFSPPSG	QMMPGPVGGF	GPMISPTMGQ
PPRAELGPPS	LSQRFAQPGA	PFGPSPLQRP	GQGLPSLPPN	TSPFPGPDPG
FPGPGGEDGG	KPLNPPASTA	FPQEPHSGSP	AAAVNGNQPS	FPPNSSGRGG
GTPDANSLAP	PGKAGGGSGP	QPPPGLVYPC	GACRSEVNDD	QDAILCEASC
QKWFHRECTG	MTESAYGLLT	TEASAVWACD	LCLKTKEIQS	VYIREGMGQL
VAANDG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як сигнальний шлях Wnt, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30257 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BRQ0 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.