PCLO

PCLO
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1UJD

Ідентифікатори
Символи PCLO, ACZ, PCH3, piccolo presynaptic cytomatrix protein
Зовнішні ІД OMIM: 604918 MGI: 1349390 HomoloGene: 69111 GeneCards: PCLO
Пов'язані генетичні захворювання
великий депресивний розлад, unipolar depression, pontocerebellar hypoplasia type 3[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• calcium-dependent phospholipid binding
• profilin binding
• calcium ion binding
• зв'язування з іоном металу
• structural constituent of presynaptic active zone

Клітинна компонента

• presynaptic active zone
• міжклітинні контакти
• синапс
• цитоскелет
• екзосома
• мембрана
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• cytoskeleton of presynaptic active zone
• presynaptic active zone cytoplasmic component

Біологічний процес

• regulation of exocytosis
• synapse assembly
• insulin secretion
• cytoskeleton organization
• cAMP-mediated signaling
• synaptic vesicle exocytosis
• protein localization to synapse
• presynapse to nucleus signaling pathway
• maintenance of presynaptic active zone structure
• synaptic vesicle clustering

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
27445
26875
Ensembl
ENSG00000186472
ENSMUSG00000061601
UniProt
Q9Y6V0
Q9QYX7
RefSeq (мРНК)
NM_033026
NM_014510
NM_001110796
NM_011995
RefSeq (білок)
NP_055325
NP_149015
NP_001104266
NP_036125
Локус (UCSC) Хр. 7: 82.75 – 83.16 Mb Хр. 5: 14.56 – 14.91 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PCLO (англ. Piccolo presynaptic cytomatrix protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 5 065 амінокислот, а молекулярна маса — 553 277[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGNEASLEGEGLPEGLAAAAAAGGGASGAGSPSHTAIPAGMEADLSQLSE
EERRQIAAVMSRAQGLPKGSVPPAAAESPSMHRKQELDSSHPPKQSGRPP
DPGRPAQPGLSKSRTTDTFRSEQKLPGRSPSTISLKESKSRTDLKEEHKS
SMMPGFLSEVNALSAVSSVVNKFNPFDLISDSEASQEETTKKQKVVQKEQ
GKPEGIIKPPLQQQPPKPIPKQQGPGRDPLQQDGTPKSISSQQPEKIKSQ
PPGTGKPIQGPTQTPQTDHAKLPLQRDASRPQTKQADIVRGESVKPSLPS
PSKPPIQQPTPGKPPAQQPGHEKSQPGPAKPPAQPSGLTKPLAQQPGTVK
PPVQPPGTTKPPAQPLGPAKPPAQQTGSEKPSSEQPGPKALAQPPGVGKT
PAQQPGPAKPPTQQVGTPKPLAQQPGLQSPAKAPGPTKTPVQAKPPSQQP
GSTKPPPQQPGPAKPSPQQPGSTKPPSQQPGSAKPSAQQPSPAKPSAQQS
TKPVSQTGSGKPLQPPTVSPSAKQPPSQGLPKTICPLCNTTELLLHVPEK
ANFNTCTECQTTVCSLCGFNPNPHLTEVKEWLCLNCQMKRALGGDLAPVP
SSPQPKLKTAPVTTTSAVSKSSPQPQQTSPKKDAAPKQDLSKAPEPKKPP
PLVKQPTLHGSPSAKAKQPPEADSLSKPAPPKEPSVPSEQDKAPVADDKP
KQPKMVKPTTDLVSSSSATTKPDIPSSKVQSQAEEKTTPPLKTDSAKPSQ
SFPPTGEKVSPFDSKAIPRPASDSKIISHPGPSSESKGQKQVDPVQKKEE
PKKAQTKMSPKPDAKPMPKGSPTPPGPRPTAGQTVPTPQQSPKPQEQSRR
FSLNLGSITDAPKSQPTTPQETVTGKLFGFGASIFSQASNLISTAGQPGP
HSQSGPGAPMKQAPAPSQPPTSQGPPKSTGQAPPAPAKSIPVKKETKAPA
AEKLEPKAEQAPTVKRTETEKKPPPIKDSKSLTAEPQKAVLPTKLEKSPK
PESTCPLCKTELNIGSKDPPNFNTCTECKNQVCNLCGFNPTPHLTENCQT
QRAISGQLGDIRKMPPAPSGPKASPMPVPTESSSQKTAVPPQVKLVKKQE
QEVKTEAEKVILEKVKETLSMEKIPPMVTTDQKQEESKLEKDKASALQEK
KPLPEEKKLIPEEEKIRSEEKKPLLEEKKPTPEDKKLLPEAKTSAPEEQK
HDLLKSQVQIAEEKLEGRVAPKTVQEGKQPQTKMEGLPSGTPQSLPKEDD
KTTKTIKEQPQPPCTAKPDQEKEDDKSDTSSSQQPKSPQGLSDTGYSSDG
ISSSLGEIPSLIPTDEKDILKGLKKDSFSQESSPSSPSDLAKLESTVLSI
LEAQASTLADEKSEKKTQPHEVSPEQPKDQEKTQSLSETLEITISEEEIK
ESQEERKDTFKKDSQQDIPSSKDHKEKSEFVDDITTRREPYDSVEESSES
ENSPVPQRKRRTSVGSSSSDEYKQEDSQGSGEEEDFIRKQIIEMSADEDA
SGSEDDEFIRNQLKEISSSTESQKKEETKGKGKITAGKHRRLTRKSSTSI
DEDAGRRHSWHDEDDEAFDESPELKYRETKSQESEELVVTGGGGLRRFKT
IELNSTIADKYSAESSQKKTSLYFDEEPELEMESLTDSPEDRSRGEGSSS
LHASSFTPGTSPTSVSSLDEDSDSSPSHKKGESKQQRKARHRPHGPLLPT
IEDSSEEEELREEEELLKEQEKQREIEQQQRKSSSKKSKKDKDELRAQRR
RERPKTPPSNLSPIEDASPTEELRQAAEMEELHRSSCSEYSPSIESDPEG
FEISPEKIIEVQKVYKLPTAVSLYSPTDEQSIMQKEGSQKALKSAEEMYE
EMMHKTHKYKAFPAANERDEVFEKEPLYGGMLIEDYIYESLVEDTYNGSV
DGSLLTRQEEENGFMQQKGREQKIRLSEQIYEDPMQKITDLQKEFYELES
LHSVVPQEDIVSSSFIIPESHEIVDLGTMVTSTEEERKLLDADAAYEELM
KRQQMQLTPGSSPTQAPIGEDMTESTMDFDRMPDASLTSSVLSGASLTDS
TSSATLSIPDVKITQHFSTEEIEDEYVTDYTREIQEIIAHESLILTYSEP
SESATSVPPSDTPSLTSSVSSVCTTDSSSPITTLDSITTVYTEPVDMITK
FEDSEEISSSTYFPGSIIDYPEEISVSLDRTAPPDGRASADHIVISLSDM
ASSIIESVVPKPEGPVADTVSTDLLISEKDPVKKAKKETGNGIILEVLEA
YRDKKELEAERTKSSLSETVFDHPPSSVIALPMKEQLSTTYFTSGETFGQ
EKPASQLPSGSPSVSSLPAKPRPFFRSSSLDISAQPPPPPPPPPPPPPPP
PPPPPPPLPPPTSPKPTILPKKKLTVASPVTTATPLFDAVTTLETTAVLR
SNGLPVTRICTTAPPPVPPKPSSIPSGLVFTHRPEPSKPPIAPKPVIPQL
PTTTQKPTDIHPKPTGLSLTSSMTLNLVTSADYKLPSPTSPLSPHSNKSS
PRFSKSLTETYVVITLPSEPGTPTDSSASQAITSWPLGSPSKDLVSVEPV
FSVVPPVTAVEIPISSEQTFYISGALQTFSATPVTAPSSFQAAPTSVTQF
LTTEVSKTEVSATRSTAPSVGLSSISITIPPEPLALDNIHLEKPQYKEDG
KLQLVGDVIDLRTVPKVEVKTTDKCIDLSASTMDVKRQITANEVYGKQIS
AVQPSIINLSVTSSIVTPVSLATETVTFVTCTASASYTTGTESLVGAEHA
MTTPLQLTTSKHAEPPYRIPSDQVFPIAREEAPINLSLGTPAHAVTLAIT
KPVTVPPVGVTNGWTDSTVSQGITDGEVVDLSTTKSHRTVVTMDESTSSV
MTKIIEDEKPVDLTAGRRAVCCDVVYKLPFGRSCTAQQPATTLPEDRFGY
RDDHYQYDRSGPYGYRGIGGMKPSMSDTNLAEAGHFFYKSKNAFDYSEGT
DTAVDLTSGRVTTGEVMDYSSKTTGPYPETRQVISGAGISTPQYSTARMT
PPPGPQYCVGSVLRSSNGVVYSSVATPTPSTFAITTQPGSIFSTTVRDLS
GIHTADAVTSLPAMHHSQPMPRSYFITTGASETDIAVTGIDISASLQTIT
MESLTAETIDSVPTLTTASEVFPEVVGDESALLIVPEEDKQQQQLDLERE
LLELEKIKQQRFAEELEWERQEIQRFREQEKIMVQKKLEELQSMKQHLLF
QQEEERQAQFMMRQETLAQQQLQLEQIQQLQQQLHQQLEEQKIRQIYQYN
YDPSGTASPQTTTEQAILEGQYAALEGSQFWATEDATTTASAVVAIEIPQ
SQGWYTVQSDGVTQYIAPPGILSTVSEIPLTDVVVKEEKQPKKRSSGAKV
RGQYDDMGENMTDDPRSFKKIVDSGVQTDDEDATDRSYVSRRRRTKKSVD
TSVQTDDEDQDEWDMPTRSRRKARVGKYGDSMTEADKTKPLSKVSSIAVQ
TVAEISVQTEPVGTIRTPSIRARVDAKVEIIKHISAPEKTYKGGSLGCQT
EADSDTQSPQYLSATSPPKDKKRPTPLEIGYSSHLRADSTVQLAPSPPKS
PKVLYSPISPLSPGKALESAFVPYEKPLPDDISPQKVLHPDMAKVPPASP
KTAKMMQRSMSDPKPLSPTADESSRAPFQYTEGYTTKGSQTMTSSGAQKK
VKRTLPNPPPEEISTGTQSTFSTMGTVSRRRICRTNTMARAKILQDIDRE
LDLVERESAKLRKKQAELDEEEKEIDAKLRYLEMGINRRKEALLKEREKR
ERAYLQGVAEDRDYMSDSEVSSTRPTRIESQHGIERPRTAPQTEFSQFIP
PQTQTESQLVPPTSPYTQYQYSSPALPTQAPTSYTQQSHFEQQTLYHQQV
SPYQTQPTFQAVATMSFTPQVQPTPTPQPSYQLPSQMMVIQQKPRQTTLY
LEPKITSNYEVIRNQPLMIAPVSTDNTFAVSHLGSKYNSLDLRIGLEERS
SMASSPISSISADSFYADIDHHTPRNYVLIDDIGEITKGTAALSTAFSLH
EKDLSKTDRLLRTTETRRSQEVTDFLAPLQSSSRLHSYVKAEEDPMEDPY
ELKLLKHQIKQEFRRGTESLDHLAGLSHYYHADTSYRHFPKSEKYSISRL
TLEKQAAKQLPAAILYQKQSKHKKSLIDPKMSKFSPIQESRDLEPDYSSY
MTSSTSSIGGISSRARLLQDDITFGLRKNITDQQKFMGSSLGTGLGTLGN
TIRSALQDEADKPYSSGSRSRPSSRPSSVYGLDLSIKRDSSSSSLRLKAQ
EAEALDVSFSHASSSARTKPTSLPISQSRGRIPIVAQNSEEESPLSPVGQ
PMGMARAAAGPLPPISADTRDQFGSSHSLPEVQQHMREESRTRGYDRDIA
FIMDDFQHAMSDSEAYHLRREETDWFDKPRESRLENGHGLDRKLPERLVH
SRPLSQHQEQIIQMNGKTMHYIFPHARIKITRDSKDHTVSMQVLEWNGIP
LTSKTYEEVQSIISQQSGEAEICVRLDLNMLSDSENSQHLELHEPPKAVD
KAKSPGVDPKQLAAELQKVSLQQSPLVLSSVVEKGSHVHSGPTSAGSSSV
PSPGQPGSPSVSKKKHGSSKLQINYDLGNLIIHILQARNLVPRDNNGYSD
PFVKVYLLPGRGAEYKRRTKHVQKSLNPEWNQTVIYKSISMEQLKKKTLE
VTVWDYDRFSSNDFLGEVLIDLSSTSHLDNTPRWYPLKEQTESIDHGKSH
SSQSSQQSPKPSVIKSRSHGIFPDPSKDMQVPTIEKSHSSPGSSKSSSEG
HLRSHGPSRSQSKTSVTQTHLEDAGAAIAAAEAAVQQLRIQPTAHKSGQS
NHARKQHRHSIAGVLPIQRTQSDNLPPPANGNQDQSQLALRKVMSDGPVK
PEGAKPPNHRPAESSVSTGSSGSSFGSGYSVDSEGSSSTAGETNLFPIPR
IGKMGQNGQEPVKQPGVGVGLADTEAKTQVMGEIKIALKKEMKTDGEQLI
VEILQCRNITYKFKSPDHLPDLYVKIYVMNISTQKKVIKKKTRVCRHDRE
PSFNETFRFSLSPAGHSLQILLFSNGGKFMKKTLIGEACIWLDKVDLRKR
IVNWHKLLVSPTQTH

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, іонами кальцію та фосфоліпідами. Локалізований у клітинних контактах, синапсах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PCLO переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13406 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q9Y6V0 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.