NLRP6

Ідентифікатори

Символи

NLRP6, AVR, CLR11.4, NALP6, NAVR, NAVR/AVR, PAN3, PYPAF5, NLR family, pyrin domain containing 6, NLR family pyrin domain containing 6

Зовнішні ІД

OMIM: 609650 MGI: 2141990 HomoloGene: 15881 GeneCards: NLRP6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • vasopressin receptor activity • ATP binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ядерна мембрана • мембрана • клітинна мембрана • inflammasome complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• response to bacterium • процес імунної системи • Загоєння ран • regulation of mucus secretion • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of immune response • regulation of autophagy • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • negative regulation of inflammatory response to antigenic stimulus • regulation of inflammatory response • negative regulation of MAPK cascade • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • вроджений імунітет • inflammatory response • G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


171389


101613

Ensembl


ENSG00000174885


ENSMUSG00000038745

UniProt


P59044


Q91WS2

RefSeq (мРНК)


NM_001276700 NM_138329


NM_001081389 NM_133946

RefSeq (білок)


NP_001263629 NP_612202


NP_598707

Локус (UCSC)

Хр. 11: 0.28 – 0.29 Mb

Хр. 7: 140.5 – 140.51 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NLRP6 (англ. NLR family pyrin domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 892 амінокислот, а молекулярна маса — 98 768^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDQPEAPCSS	TGPRLAVARE	LLLAALEELS	QEQLKRFRHK	LRDVGPDGRS
IPWGRLERAD	AVDLAEQLAQ	FYGPEPALEV	ARKTLKRADA	RDVAAQLQER
RLQRLGLGSG	TLLSVSEYKK	KYREHVLQLH	ARVKERNARS	VKITKRFTKL
LIAPESAAPE	EAMGPAEEPE	PGRARRSDTH	TFNRLFRRDE	EGRRPLTVVL
QGPAGIGKTM	AAKKILYDWA	AGKLYQGQVD	FAFFMPCGEL	LERPGTRSLA
DLILDQCPDR	GAPVPQMLAQ	PQRLLFILDG	ADELPALGGP	EAAPCTDPFE
AASGARVLGG	LLSKALLPTA	LLLVTTRAAA	PGRLQGRLCS	PQCAEVRGFS
DKDKKKYFYK	YFRDERRAER	AYRFVKENET	LFALCFVPFV	CWIVCTVLRQ
QLELGRDLSR	TSKTTTSVYL	LFITSVLSSA	PVADGPRLQG	DLRNLCRLAR
EGVLGRRAQF	AEKELEQLEL	RGSKVQTLFL	SKKELPGVLE	TEVTYQFIDQ
SFQEFLAALS	YLLEDGGVPR	TAAGGVGTLL	RGDAQPHSHL	VLTTRFLFGL
LSAERMRDIE	RHFGCMVSER	VKQEALRWVQ	GQGQGCPGVA	PEVTEGAKGL
EDTEEPEEEE	EGEEPNYPLE	LLYCLYETQE	DAFVRQALCR	FPELALQRVR
FCRMDVAVLS	YCVRCCPAGQ	ALRLISCRLV	AAQEKKKKSL	GKRLQASLGG
GSSSQGTTKQ	LPASLLHPLF	QAMTDPLCHL	SSLTLSHCKL	PDAVCRDLSE
ALRAAPALTE	LGLLHNRLSE	AGLRMLSEGL	AWPQCRVQTV	RVQLPDPQRG
LQYLVGMLRQ	SPALTTLDLS	GCQLPAPMVT	YLCAVLQHQG	CGLQTLSLAS
VELSEQSLQE	LQAVKRAKPD	LVITHPALDG	HPQPPKELIS	TF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95—104. PMID 12563287 DOI:10.1038/nrm1019

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22944 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P59044 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2012. Процитовано 8 вересня 2017.