ITGA4

ITGA4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4HKC, 3V4P, 3V4V, 5FPI, 5C7Z

Ідентифікатори
Символи ITGA4, CD49D, IA4, integrin subunit alpha 4
Зовнішні ІД OMIM: 192975 MGI: 96603 HomoloGene: 37364 GeneCards: ITGA4
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• protein antigen binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0003823, GO:0051635 antigen binding
• fibronectin binding
• cell adhesion molecule binding
• coreceptor activity
• C-X3-C chemokine binding
• protein heterodimerization activity

Клітинна компонента

• екзосома
• integral component of membrane
• мембрана
• focal adhesion
• cell surface
• integrin alpha4-beta7 complex
• integrin complex
• клітинна мембрана
• growth cone
• neuronal cell body
• GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

• endodermal cell differentiation
• B cell differentiation
• positive regulation of T cell migration
• extracellular matrix organization
• heterotypic cell-cell adhesion
• substrate adhesion-dependent cell spreading
• cellular response to cytokine stimulus
• cell-matrix adhesion involved in ameboidal cell migration
• cell-matrix adhesion
• leukocyte tethering or rolling
• Діапедез
• regulation of immune response
• integrin-mediated signaling pathway
• leukocyte migration
• positive regulation of leukocyte tethering or rolling
• positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion
• positive regulation of leukocyte migration
• import into cell
• leukocyte cell-cell adhesion
• negative regulation of protein homodimerization activity
• clathrin-dependent extracellular exosome endocytosis
• адгезія клітин
• receptor clustering
• cell-cell adhesion mediated by integrin
• axonogenesis involved in innervation
• cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus
• cellular response to amyloid-beta
• positive regulation of vascular endothelial cell proliferation
• neuron projection extension
• positive regulation of endothelial cell apoptotic process

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3676
16401
Ensembl
ENSG00000115232
ENSMUSG00000027009
UniProt
P13612
Q00651
RefSeq (мРНК)
NM_000885
NM_001316312
NM_010576
RefSeq (білок)
NP_000876
NP_001303241
NP_034706
Локус (UCSC) Хр. 2: 181.46 – 181.54 Mb Хр. 2: 79.09 – 79.16 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGA4 (англ. Integrin subunit alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 114 900[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNT
LFGYSVVLHSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQT
CEQLQLGSPNGEPCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKN
IFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQA
GISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLDKQNQVKFGSY
LGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILHEMKGK
KLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAV
MNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAI
YIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAV
GAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSHPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTL
CFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQV
SSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ
PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLA
VGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEV
TDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATC
ENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGSNDENEPETC
MVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQTTTG
ECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF
LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRV
IELNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMW
KAGFFKRQYKSILQEENRRDSWSYINSKSNDD

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

  • Rubio M., Nueda A., Vara A., Corbi-Lopez A.L. (1992). A single mRNA encodes the alpha 150 and alpha 80/70 forms of the alpha subunit of VLA4. Eur. J. Immunol. 22: 1099—1102. PMID 1551405 DOI:10.1002/eji.1830220434
  • Szabo M.C., McIntyre B.W. (1995). Identification of two variants of the human integrin alpha 4 subunit. Mol. Immunol. 32: 1453—1454. PMID 8643114 DOI:10.1016/0161-5890(96)00001-6
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Rosen G.D., Birkenmeier T.M., Dean D.C. (1991). Characterization of the alpha 4 integrin gene promoter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4094—4098. PMID 2034655 DOI:10.1073/pnas.88.10.4094
  • Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239—3243. PMID 3033641 DOI:10.1073/pnas.84.10.3239
  • Luissint A.C., Lutz P.G., Calderwood D.A., Couraud P.O., Bourdoulous S. (2008). JAM-L-mediated leukocyte adhesion to endothelial cells is regulated in cis by alpha4beta1 integrin activation. J. Cell Biol. 183: 1159—1173. PMID 19064666 DOI:10.1083/jcb.200805061

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6140 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, P13612 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350