DCP1B

Ідентифікатори

Символи

DCP1B, DCP1, hDcp1b, decapping mRNA 1B

Зовнішні ІД

OMIM: 609843 MGI: 2442404 HomoloGene: 51881 GeneCards: DCP1B

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0010576 enzyme regulator activity • GO:0010577 enzyme activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • hydrolase activity
Клітинна компонента	• P-body • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA • deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


196513


319618

Ensembl


ENSG00000151065 ENSG00000284850


ENSMUSG00000041477

UniProt


Q8IZD4


B9EIX0

RefSeq (мРНК)


NM_152640 NM_001319292


NM_001033379

RefSeq (білок)


NP_001306221 NP_689853


NP_001028551

Локус (UCSC)

Хр. 12: 1.95 – 2 Mb

Хр. 6: 119.18 – 119.22 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DCP1B (англ. Decapping mRNA 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 67 723^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVAAGGLV	GKGRDISLAA	LQRHDPYINR	IVDVASQVAL	YTFGHRANEW
EKTDVEGTLF	VYTRSASPKH	GFTIMNRLSM	ENRTEPITKD	LDFQLQDPFL
LYRNARLSIY	GIWFYDKEEC	QRIAELMKNL	TQYEQLKAHQ	GTGAGISPVI
LNSGEGKEVD	ILRMLIKAKD	EYTKCKTCSE	PKKITSSSAI	YDNPNLIKPI
PVKPSENQQQ	RIPQPNQTLD	PEPQHLSLTA	LFGKQDKATC	QETVEPPQTL
HQQQQQQQQQ	QEKLPIRQGV	VRSLSYEEPR	RHSPPIEKQL	CPAIQKLMVR
SADLHPLSEL	PENRPCENGS	THSAGEFFTG	PVQPGSPHNI	GTSRGVQNAS
RTQNLFEKLQ	STPGAANKCD	PSTPAPASSA	ALNRSRAPTS	VTPVAPGKGL
AQPPQAYFNG	SLPPQTVGHQ	AHGREQSTLP	RQTLPISGSQ	TGSSGVISPQ
ELLKKLQIVQ	QEQQLHASNR	PALAAKFPVL	AQSSGTGKPL	ESWINKTPNT
EQQTPLFQVI	SPQRIPATAA	PSLLMSPMVF	AQPTSVPPKE	RESGLLPVGG
QEPPAAATSL	LLPIQSPEPS	VITSSPLTKL	QLQEALLYLI	QNDDNFLNII
YEAYLFSMTQ	AAMKKTM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Lykke-Andersen J. (2002). Identification of a human decapping complex associated with hUpf proteins in nonsense-mediated decay. Mol. Cell. Biol. 22: 8114—8121. PMID 12417715 DOI:10.1128/MCB.22.23.8114-8121.2002
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Cougot N., Babajko S., Seraphin B. (2004). Cytoplasmic foci are sites of mRNA decay in human cells. J. Cell Biol. 165: 31—40. PMID 15067023 DOI:10.1083/jcb.200309008

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DCP1B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24451 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IZD4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.