60S-рибосомний білок L6

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4D67, 4D5Y, 4UJE

Ідентифікатори

Символи

RPL6, L6, SHUJUN-2, TAXREB107, TXREB1, ribosomal protein L6

Зовнішні ІД

OMIM: 603703 MGI: 3647789 HomoloGene: 31001 GeneCards: RPL6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • structural constituent of ribosome • cadherin binding • RNA binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • рибосома • мембрана • focal adhesion • внутрішньоклітинний • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • cytosolic large ribosomal subunit • клітинне ядро • цитоплазма • ендоплазматичний ретикулум • rough endoplasmic reticulum • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • polysomal ribosome • синапс
Біологічний процес	• cytoplasmic translation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Біосинтез білків • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • ribosomal large subunit assembly • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • rRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6128


432502

Ensembl


ENSG00000089009


н/д

UniProt


Q02878


н/д

RefSeq (мРНК)

NM_000970 NM_001024662 NM_001320137 NM_001320138 NM_001320139
NM_001320140 NM_001320141 NM_001320142


XM_036156129

RefSeq (білок)

NP_000961 NP_001019833 NP_001307066 NP_001307067 NP_001307068
NP_001307069 NP_001307070 NP_001307071


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 12: 112.41 – 112.42 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

60S-рибосомний білок L6 (англ. Ribosomal protein L6) – білок, який кодується геном RPL6, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 288 амінокислот, а молекулярна маса — 32 728^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGEKVEKPD	TKEKKPEAKK	VDAGGKVKKG	NLKAKKPKKG	KPHCSRNPVL
VRGIGRYSRS	AMYSRKAMYK	RKYSAAKSKV	EKKKKEKVLA	TVTKPVGGDK
NGGTRVVKLR	KMPRYYPTED	VPRKLLSHGK	KPFSQHVRKL	RASITPGTIL
IILTGRHRGK	RVVFLKQLAS	GLLLVTGPLV	LNRVPLRRTH	QKFVIATSTK
IDISNVKIPK	HLTDAYFKKK	KLRKPRHQEG	EIFDTEKEKY	EITEQRKIDQ
KAVDSQILPK	IKAIPQLQGY	LRSVFALTNG	IYPHKLVF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків.

Література

Zaman G.J.R. (1993). Sequence of a cDNA encoding human ribosomal protein L26 and of a cDNA probably encoding human ribosomal protein L6. Nucleic Acids Res. 21: 1673—1673. PMID 8479925 DOI:10.1093/nar/21.7.1673
Kenmochi N., Yoshihama M., Higa S., Tanaka T. (2000). The human ribosomal protein L6 gene in a critical region for Noonan syndrome. J. Hum. Genet. 45: 290—293. PMID 11043511 DOI:10.1007/s100380070018
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ohta K., Endo T., Gunji K., Onaya T. (1994). Isolation of a cDNA whose expression is markedly increased in malignantly transformed FRTL cells and neoplastic human thyroid tissues. J. Mol. Endocrinol. 12: 85—92. PMID 8185817 DOI:10.1677/jme.0.0120085
Jaekel S., Mingot J.-M., Schwarzmaier P., Hartmann E., Goerlich D. (2002). Importins fulfill a dual function as nuclear import receptors and cytoplasmic chaperones for exposed basic domains. EMBO J. 21: 377—386. PMID 11823430 DOI:10.1093/emboj/21.3.377

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10362 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, Q02878 (англ.) . Архів оригіналу за 23 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)

Білки

Фактори ініціації трансляції

Фактори ініціації трансляції прокаріотів

PIF-1
PIF-2
PIF-3

Фактори ініціації трансляції археїв

aIF1
aIF2
aIF5
aIF6

Фактори ініціації трансляції еукаріотів

eIF1	eIF1 AX AY B

eIF2	α β γ eIF2B 1 2 3 4 5 кіназа eIF2A eIF2D

eIF3	A B C D E F G H I J K L M

eIF4	EIF4A2 A3 B E1 E2 E3 G1 G2 G3 H

eIF5	EIF5 A A2 5B

eIF6	EIF6

Фактори елонгації трансляції

Фактори елонгації трансляції прокаріотів	EF-Tu EF-Ts EF-G

Фактори елонгації трансляції археїв	aEF-1, aEF-2

Фактори елонгації трансляції еукаріотів	EEF-1 A1 A2 A3 B1 B2 B3 B4 D E1 G EEF2

Фактори термінації трансляції

Фактори термінації трансляції прокаріотів
Фактори термінації трансляції археїв
Фактори термінації трансляції еукаріотів

Клас 1
- eRF1
Клас 2/RF3
- GSPT1
- GSPT2

Рибосомні білки

Цитоплазмові

підрозділ 60S	RPL3 4 5 6 7 7A 8 9 10 A L 11 12 13 13A 14 15 17 18 18A 19 21 22 23 23A 24 26 27 27A 28 29 30 31 32 34 35 35A 36 36A 37 37A 38 39 40 41 P0 P1 P2 RRP15 RSL24D1

підрозділ 40S	RPSA 2 3 3A RPS4 X Y1 Y2 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 15A 16 17 18 19 20 21 23 24 25 26 27 27A 28 29 30 RACK1

Мітохондріальні

підрозділ 39S	MRPL1 2 3 4 6 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58

підрозділ 28S	MRPS1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 14 15 16 17 18 A B C 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 33 34 35 36